O interior é de três naves seccionadas por arcos formeiros de volta perfeita assentes em pilares oitavados, cujos capitéis são decorados por faixas horizontais de hastes entrançadas. A Capela do Santíssimo é original e foi edificada certamente com fins funerários. Encontra-se revestida por azulejos e um retábulo barrocos, mas a sua cobertura é em abóbada de cruzaria de ogivas, dotada de bocete central decorado com a cruz de Cristo, elemento que identifica o seu promotor com uma personagem desta Ordem. De acordo com a leitura de Manuel Castelo RAMOS, 1996, p.124, as mísulas que suportam esta abóbada são de um tipo que pode corresponder aos "meados dos anos vinte", indício que permite estabelecer, com bases mais seguras, a possível cronologia da campanha.